Nacido en Orense el 14 de abril de 1841, Juan Manuel Amor sobresalió desde joven en los reducidos círculos provincianos del librepensamiento y del republicanismo de su ciudad natal. Estudió en Madrid en la Escuela Facultativa de Diplomática de la Universidad Central, donde obtuvo el título de Archivero, Bibliotecario y Arqueólogo. Director de la Biblioteca Pública Provincial de Orense durante toda su carrera profesional, perteneció a esa primera generación del republicanismo histórico de Galicia como sus hermanos masones Francisco Suárez García, Indalecio Armesto, Segundo Moreno Barcia, Santiago Casares Paz, Manuel Leiras Pulpeiro y otros.
Posiblemente fue iniciado en la Masonería durante su estancia en Madrid, donde asumiría como nombre simbólico Assi. En palabras de Alberto Valín, " la masonería orensana le debe, sin duda, sus principios".
Fue Venerable Maestro y fundador de la primera logia masónica en Ourense, la RLS:. Auria nº 59/ nº 10 (1871-1889), a la que pertenecieron figuaras como la de Manuel Curros Enríquez. Maestro Masón, alcanzaría el grado 18º según el Rito Escocés Antiguo y Aceptado (R.E.A.A.).
Con el apoyo de la Sociedad de Librepensadores de Orense, el Centro de Sociedades Obreras, la Sociedad de Amigos de Orense en La Habana y la masonería local co-fundó y presidió la Escuela Laica Neutral de Orense, primer y único centro de enseñanza laico de Orense erigido por el maestro y masón Hipólito Sinforiano Luengo.
Falleció en su ciudad natal el 8 de julio de 1911.
"Juan Manuel Amor quiso que la pureza resplandeciese en sus acciones, palabras y pensamientos, y empleó su energía en vivir según su conciencia, con la noble entereza de un filósofo antiguo. Este fue su triunfo y es el ejemplo que nos dio con su vida sería digna y austera."
Vicente Risco